Protein–RNA interactions for Protein: P55302

Lrpap1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrpap1P55302 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrpap1P55302 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms