Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1P55194 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms