Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GemP55041 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GemP55041 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GemP55041 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GemP55041 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GemP55041 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GemP55041 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GemP55041 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GemP55041 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GemP55041 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GemP55041 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GemP55041 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GemP55041 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GemP55041 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GemP55041 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GemP55041 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GemP55041 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GemP55041 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GemP55041 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GemP55041 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GemP55041 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GemP55041 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GemP55041 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GemP55041 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GemP55041 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GemP55041 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GemP55041 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GemP55041 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GemP55041 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GemP55041 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GemP55041 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GemP55041 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GemP55041 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GemP55041 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GemP55041 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GemP55041 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GemP55041 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GemP55041 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GemP55041 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GemP55041 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GemP55041 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GemP55041 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GemP55041 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GemP55041 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GemP55041 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GemP55041 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GemP55041 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GemP55041 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms