Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ClgnP52194 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClgnP52194 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClgnP52194 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms