Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csrp3P50462 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrp3P50462 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms