Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpreP49446 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpreP49446 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpreP49446 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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PtpreP49446 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpreP49446 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpreP49446 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpreP49446 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpreP49446 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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