Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rfx1P48377 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Rfx1P48377 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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Rfx1P48377 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Rfx1P48377 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Rfx1P48377 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Rfx1P48377 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Rfx1P48377 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Rfx1P48377 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Rfx1P48377 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx1P48377 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Rfx1P48377 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Rfx1P48377 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Rfx1P48377 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx1P48377 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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