Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gli1P47806 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gli1P47806 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gli1P47806 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gli1P47806 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms