Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf1P46099 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf1P46099 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf1P46099 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf1P46099 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf1P46099 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf1P46099 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf1P46099 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms