Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmx2P43687 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmx2P43687 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hmx2P43687 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms