Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgavP43406 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgavP43406 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgavP43406 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms