Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgfrP43117 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgfrP43117 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms