Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbP41155 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbP41155 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbP41155 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbP41155 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbP41155 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbP41155 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbP41155 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbP41155 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbP41155 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbP41155 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbP41155 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbP41155 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbP41155 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbP41155 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbP41155 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbP41155 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbP41155 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbP41155 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbP41155 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbP41155 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms