Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk2P38575 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk2P38575 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk2P38575 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms