Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PpargP37238 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PpargP37238 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PpargP37238 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PpargP37238 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PpargP37238 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PpargP37238 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PpargP37238 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PpargP37238 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpargP37238 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpargP37238 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpargP37238 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PpargP37238 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PpargP37238 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PpargP37238 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PpargP37238 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PpargP37238 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PpargP37238 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PpargP37238 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PpargP37238 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PpargP37238 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PpargP37238 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms