Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin1P35438 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin1P35438 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin1P35438 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin1P35438 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin1P35438 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin1P35438 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms