Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptk2P34152 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms