Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2aP34056 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms