Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pola1P33609 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pola1P33609 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pola1P33609 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pola1P33609 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pola1P33609 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pola1P33609 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pola1P33609 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pola1P33609 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pola1P33609 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms