Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa11P31311 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa11P31311 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms