Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprmP28828 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprmP28828 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprmP28828 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprmP28828 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprmP28828 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms