Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dusp1P28563 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dusp1P28563 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dusp1P28563 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms