Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd9P28357 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms