Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LoxP28301 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LoxP28301 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LoxP28301 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LoxP28301 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LoxP28301 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LoxP28301 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LoxP28301 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LoxP28301 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LoxP28301 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LoxP28301 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LoxP28301 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LoxP28301 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LoxP28301 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LoxP28301 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LoxP28301 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LoxP28301 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LoxP28301 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LoxP28301 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LoxP28301 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LoxP28301 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LoxP28301 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LoxP28301 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LoxP28301 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LoxP28301 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LoxP28301 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LoxP28301 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LoxP28301 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LoxP28301 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LoxP28301 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LoxP28301 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LoxP28301 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LoxP28301 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LoxP28301 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LoxP28301 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LoxP28301 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LoxP28301 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LoxP28301 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LoxP28301 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LoxP28301 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LoxP28301 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LoxP28301 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms