Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6aP27664 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6aP27664 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pde6aP27664 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6aP27664 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6aP27664 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pde6aP27664 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pde6aP27664 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pde6aP27664 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6aP27664 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6aP27664 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6aP27664 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6aP27664 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6aP27664 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6aP27664 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6aP27664 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6aP27664 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6aP27664 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde6aP27664 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde6aP27664 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde6aP27664 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde6aP27664 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pde6aP27664 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pde6aP27664 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde6aP27664 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde6aP27664 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms