Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfraP26618 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms