Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NdnP25233 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NdnP25233 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NdnP25233 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NdnP25233 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NdnP25233 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NdnP25233 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NdnP25233 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NdnP25233 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NdnP25233 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NdnP25233 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NdnP25233 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NdnP25233 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NdnP25233 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NdnP25233 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NdnP25233 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NdnP25233 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NdnP25233 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NdnP25233 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NdnP25233 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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