Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk11bP24788 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms