Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou3f1P21952 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms