Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KitlgP20826 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms