Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prim1P20664 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim1P20664 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim1P20664 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim1P20664 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prim1P20664 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prim1P20664 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms