Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcaP20444 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms