Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou5f1P20263 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms