Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms