Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnni2P13412 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni2P13412 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms