Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms