Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DmdP11531 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DmdP11531 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DmdP11531 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DmdP11531 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DmdP11531 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DmdP11531 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DmdP11531 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DmdP11531 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DmdP11531 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DmdP11531 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DmdP11531 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DmdP11531 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DmdP11531 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DmdP11531 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DmdP11531 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DmdP11531 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DmdP11531 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DmdP11531 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DmdP11531 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DmdP11531 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DmdP11531 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DmdP11531 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DmdP11531 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DmdP11531 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DmdP11531 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DmdP11531 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DmdP11531 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DmdP11531 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DmdP11531 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DmdP11531 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DmdP11531 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DmdP11531 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DmdP11531 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DmdP11531 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DmdP11531 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DmdP11531 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DmdP11531 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DmdP11531 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DmdP11531 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DmdP11531 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DmdP11531 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DmdP11531 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DmdP11531 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DmdP11531 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DmdP11531 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DmdP11531 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DmdP11531 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DmdP11531 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DmdP11531 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DmdP11531 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DmdP11531 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DmdP11531 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DmdP11531 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DmdP11531 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DmdP11531 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DmdP11531 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DmdP11531 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DmdP11531 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DmdP11531 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DmdP11531 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DmdP11531 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DmdP11531 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DmdP11531 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DmdP11531 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DmdP11531 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DmdP11531 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DmdP11531 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DmdP11531 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DmdP11531 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DmdP11531 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DmdP11531 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms