Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms