Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nid1P10493 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nid1P10493 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms