Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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P10404 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P10404 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P10404 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P10404 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P10404 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P10404 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P10404 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P10404 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P10404 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P10404 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P10404 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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P10404 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P10404 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P10404 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P10404 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P10404 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P10404 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P10404 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P10404 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P10404 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P10404 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P10404 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P10404 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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