Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprqP0C5E4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms