Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csf3P09920 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3P09920 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms