Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hoxb5P09079 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb5P09079 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms