Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms