Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms