Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P06323 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P06323 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06323 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06323 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06323 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06323 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms