Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tk1P04184 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tk1P04184 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tk1P04184 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tk1P04184 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tk1P04184 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tk1P04184 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tk1P04184 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tk1P04184 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tk1P04184 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms