Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col4a1P02463 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a1P02463 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms