Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-AaP01910 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms