Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01800 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01800 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01800 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01800 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01800 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01800 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01800 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01800 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01800 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01800 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01800 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01800 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01800 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01800 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01800 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01800 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01800 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms